維生素B2經腎小球濾過，可在腎小管中再吸收

FAD是由FMN透過FAD合成酶作用形成的。此酶廣泛存在於組織的胞漿內，也需要ATP二價陽離子，FMN及其類似物都可作為底物、異核黃素干擾其活力，對FMN及FAD有拮抗作用。維生素B2缺乏及甲狀腺過多時，FAD合成酶活力增加。

水解FMN及FAD的酶廣泛存在各組織中。FMN磷酶在鹼性或酸性中都能作用，在肝中酸性磷酸對FMN的作用較強，在維生素B2缺乏時，並不影響FMN磷酸酶的活力。FAD焦磷酸酶也能促使FAD水解。它在肝病病人的血清中升高。

維生素B2經腎小球濾過，可在腎小管中再吸收。在血清維生素B2濃度低時，尿排出量較少，為一常數。但血清維生素B2達到1μg·ml-1時，排出增多。維生素B2攝取量愈小，體內儲存百分率愈大。給予大鼠55μg14C-一維生素B2，10%的14C從尿中排出，3%在大便中排出，1%從呼吸道以CO2形式排出。但如劑量增加（15μg·ml-1飼料），10%14C從便中排出。所以核黃素主要從尿中以遊離式排出。腸道細菌分解的僅為一小部分，而且環狀部比較穩定，僅側鏈分解。維生素B2在體內的轉換率與劑量大小有關，大鼠正常劑量時，每日排出15～20μg維生素B2，生物半壽期為16日，劑量大時排出多，生物半壽期也短。

大鼠皮下注射6倍正常劑量的標記維生素B2，1h後，腎、小腸及肝有最高放射活性。腹腔注射後，其分泌情況與皮下注射者一樣，但肝中之量非常高。FMN在腸中合成，FAD在腎中及肝中合成。其合成放射活性維生素B2＞FMN＞FAD，說明了合成的次序。如腹腔內注射中等劑量，量高放射活性在肝及腎中，其次為腸，再次為其他組織，而血中最低。在肝中主要為FAD。皮下注射正常劑量，1。5h後，肝中有17%的放射活性。其中80%為FAD。